พลังงานกุณฑลินีอยู่ที่ฐานของกระดูกสันหลัง (เรียกว่ากระดูกศักรัมในภาษาอังกฤษ) และอยู่ในสภาวะสงบ พลังงานนี้จะตื่นขึ้นได้โดยการท่องมนต์ที่ได้รับจากครูบาอาจารย์ในใจ และผ่านการทำสมาธิ
ในโยคะมีบันธะ (การล็อกพลังงาน) สามประเภท กุณฑลินีควบคุมบันธะเหล่านี้ด้วยตัวเอง ในสภาวะของการทำสมาธิ พลังงานที่มีสติสัมปชัญญะนี้จะควบคุมร่างกาย จิตใจ ปราณ และสติปัญญาของมนุษย์ และทำกิจกรรมโยคะทั้งหมดโดยอัตโนมัติ ผู้ฝึกไม่สามารถหยุดมันได้แม้ว่าเขาหรือเธอต้องการ และไม่สามารถทำมันโดยสมัครใจได้ เขาหรือเธอหลับตาและทำสมาธิโดยมีครูบาอาจารย์เป็นพยานในจักระอัจนะ นี่คือโยคะที่อธิบายไว้ในโยคะของปาทัญจลี
ปรัชญาโยคะของอินเดียกล่าวถึงตปัส (ความทุกข์) สามประเภทเพื่อบรรเทา ได้แก่ อดิ ดาฮิก (ทางกาย) อดิ ภาจิก (ทางจิตใจ/สิ่งแวดล้อม) และอดิ ไดวิก (ทางจิตวิญญาณ) กล่าวคือ โรคทางกาย โรคทางจิต โรคทางจิตวิญญาณ ไม่มีโรคใดอยู่นอกเหนือจากสามประเภทนี้ โยคะที่สอนกันในปัจจุบันส่วนใหญ่เป็นการออกกำลังกายทางกายภาพธรรมดา ในแง่นี้ แพทย์กระดูกและนักกายภาพบำบัดจึงถูกต้องกว่าครูโยคะบางคน เพราะนั่นไม่ใช่โยคะที่แท้จริง
โยคะถูกชี้นำโดยพลังกุณฑลินี มันเคลื่อนไหวเฉพาะอวัยวะที่ทำงานได้ไม่เต็มที่เท่านั้น มันทำโยคะเฉพาะกับอวัยวะที่ป่วยหรือเสียหาย ด้วยเหตุนี้ ผู้ฝึกแต่ละคนจึงมีประสบการณ์โยคะแตกต่างกัน คนหนึ่งมีปัญหาอย่างหนึ่ง อีกคนมีปัญหาอีกอย่างหนึ่ง โยคะกุณฑลินีทำเพื่อแก้ไขระบบทางกายภาพที่ป่วยนั้น มันจะเติบโตไม่ได้จนกว่าระบบนั้นจะแข็งแรงสมบูรณ์ ดังนั้น ควรฝึกสมาธิในลักษณะนี้: โยคะไม่ได้ทำขณะเดินหรือเคลื่อนไหว แต่ทำในสภาวะของการทำสมาธิ ไม่มีอะไรเกิดขึ้นโดยที่เราไม่ต้องการ ไม่มีอะไรต้องกังวล จริงอยู่ที่ว่าเมื่อฝึกโยคะ ผู้สังเกตการณ์อาจจะรู้สึกกลัวและสงสัยว่ามีปัญหาอะไร แต่ลองถามผู้ที่ได้สัมผัสดูสิ พวกเขาจะบอกคุณถึงความสุขที่ได้รับ ชีวิตที่แท้จริงเริ่มต้นที่นี่ ดังนั้น จงนั่งสมาธิวันละสองครั้งและท่องมนต์สัญชีวนีอย่างต่อเนื่องในใจ
ระหว่างการนั่งสมาธิ บันธาแรกจะถูกกระตุ้นที่ราก โดยพื้นฐานแล้ว พลังงานกุณฑาลินีจะบริหารกระดูกสันหลัง เพราะกุณฑาลินีต้องเคลื่อนตัวขึ้นผ่านไขสันหลัง สหัสราระเชื่อมต่อกับไขสันหลัง ไม่มีแม้แต่รูขุมขนเดียวที่ไม่เชื่อมต่อกับไขสันหลัง กระดูกสันหลังจะโค้งงอในมุมที่เหมาะสมเพื่อรักษาอวัยวะแต่ละส่วน ผู้ป่วยเบาหวานลองโยคะแบบหนึ่ง ผู้ป่วยหอบหืดลองโยคะอีกแบบหนึ่ง และผู้ป่วยโรคข้ออักเสบลองโยคะอีกแบบหนึ่ง การฝึกโยคะจะดำเนินต่อไปจนกว่าอวัยวะนั้นจะแข็งแรงสมบูรณ์ ดังนั้น บันธาแรกจึงถูกกระตุ้นที่รากด้วยการออกกำลังกายเฉพาะสำหรับกระดูกสันหลัง อย่างไรก็ตาม เนื่องจากระบบทั้งหมดเชื่อมต่อกัน ร่างกายทั้งหมดจึงเคลื่อนไหวไปพร้อมกัน
เมื่อพลังกุณฑลินีขึ้นสูงกว่าสะดือ บันธาที่สอง หรืออุดทยานะบันธา จะถูกกระตุ้น กระบวนการนี้เกิดขึ้นโดยอัตโนมัติ ไม่สามารถบังคับได้ สะดือจะพับเข้าหาแนวกระดูกสันหลัง จากนั้น เมื่อพลังกุณฑลินีขึ้นไปสู่โพรงคอ (เรียกว่ากันตกุปะ) บันธาที่สาม หรือจาลันธราบันธา จะทำงาน หลังจากขั้นตอนนี้ การออกกำลังกายที่เกี่ยวข้องกับกระดูกสันหลังส่วนบนจะทำไม่ได้อีกต่อไป ปราณายามะจะเริ่มต้นโดยอัตโนมัติ มีปราณายามะหลายร้อยประเภท แม้ว่าจะมีเพียงไม่กี่ประเภทที่อธิบายไว้ในตำราโยคะ ส่วนอาสนะ มีเพียงไม่กี่ท่าที่กล่าวถึงในคัมภีร์ แต่ในความเป็นจริงแล้วมีอาสนะเฉพาะหลายร้อยท่าสำหรับโรคต่างๆ ของอวัยวะ เมื่อปราณายามะเริ่มต้น การกลั้นลมหายใจอย่างสมบูรณ์ (กุมภกะ) จะเกิดขึ้น พลังกุณฑลินีขึ้นไปสู่จักระอัจนะและสูงกว่านั้น ผู้ฝึกจะเข้าสู่สมาธิ ไม่ใช่ทุกคนที่ต้องการโยคะประเภทนี้ หากร่างกายแข็งแรงและปราศจากโรคภัยไข้เจ็บ ก็ไม่จำเป็นต้องฝึกโยคะ
อย่างไรก็ตาม แม้จะเป็นเพียงอาการเจ็บป่วยเล็กน้อย โยคะก็สามารถช่วยแก้ไขได้ ดังนั้น โยคะในรูปแบบนี้จึงสามารถรักษาโรคภัยไข้เจ็บของมนุษย์ได้แทบทุกชนิด
